Η δράση λαμβάνει χώρα στη Μόσχα το 1584 και ξεκινά μια διαμάχη στο Boyarsky Duma: Ο Μιχαήλ Ναγκόι, ο αδελφός της Τσαρίνας Μαρία Φεντόροβνα, υποστηρίζει μια θέση με τον Σαλτίκοφ και προσελκύει τους εναπομείναντες μπούρους στη Σουάρα. Ο Ζαχαρίν-Γιουριέφ, ο αδελφός της συζύγου του πρώτου τσάρου, διαλύει τις διαμάχες, μιλώντας για τη σημασία της συλλογής της υπόθεσής τους: Ο Τζον, βασανισμένος από τύψεις μετά τη δολοφονία του γιου του, αποφάσισε να πάρει τη μοναστική τάξη και έδωσε εντολή στη Δούμα να επιλέξει διάδοχο. Εν τω μεταξύ, «οι εχθροί πολεμούν τη Ρωσία από όλες τις πλευρές», σε αυτό είναι ο λοιμός και ο λιμός. Ο πρίγκιπας Mstislavsky μιλά για την σκληρότητα του βασιλιά στην απόφασή του. Ο Ναγκόγια προσφέρει στον νεαρό Ντμίτρι Τσάρεβιτς τη βασίλισσα και, εάν είναι απαραίτητο, τον «κυβερνήτη», τον οποίο είναι έτοιμος να γίνει. Sitsky - Zakharyin, ο οποίος δεν έχει λεκιάσει με τίποτα. Ο Ζαχαρίν μιλάει για τον Ιβάν Πετρόβιτς Σούισκι, που τώρα κάθεται στον πολιορκημένο Ψκόφ.
Ωστόσο, ο βασιλιάς χρειάζεται αμέσως. Ο Ζαχαρίν ζητάει από τον Γκοντούνοφ συμβουλές, ποιος δεν επιδιορθώθηκε σε μέρη και που κάθισε μετριοπαθώς κάτω. Αυτός, αφού περιέγραψε λεπτομερώς την αξιοζήλευτη θέση του κράτους, μιλάει για την αδυναμία αλλαγής του βασιλιά σε μια τέτοια στιγμή και καλεί τους μποϊάρους να ζητήσουν από τον Ιωάννη να παραμείνει στο θρόνο. Ο Σίτσκι, θυμάται τις φρικαλεότητες του τσάρου, προσπαθεί μάταια να σταματήσει τους μπούρους. Πηγαίνουν στο τσάρο, αποφασίζοντας ποιος θα μιλήσει και δειλό κυρίαρχο θυμό. Ο Γκόντονοφ αναλαμβάνει τον κίνδυνο. Ο Τζον, ήδη ντυμένος με μαύρο κασκόλ, αφού έχει αφαιρέσει το καπέλο του Μονομάχ, περιμένει στην κρεβατοκάμαρα για την απόφαση των μπογιάρ και θρηνεί από την ανάμνηση του τελευταίου κακού. Ένας αγγελιοφόρος φτάνει από τον Pskov, τον οποίο ο τσάρος αρχικά αναφέρεται στον «νέο άρχοντα», αλλά στη συνέχεια, ακούγοντας ότι τα νέα είναι χαρούμενα, ακούει μια ιστορία για τον προβληματισμό των επιθέσεων και την υποχώρηση του Batur από τον Pskov. Λαμβάνει μια επιστολή από τον Κούρμπσκι, στην οποία κατακρίνει τον τσάρο με μια περίεργη συλλαβή, απειλεί με την ταχεία σύλληψη του Ψκόφ, πολλές από τις φρικαλεότητες του Τζον αποκαλούν την αιτία των τρεχουσών ηττών του και υπενθυμίζει δηλητηριωδώς την απομάκρυνσή του από την επιχείρηση. Ο Τζον είναι εξαγριωμένος, γιατί, αφού κατέστρεψε όλους τους συγγενείς του Κούρμπσκι, είναι ανίσχυρος να κλαίει για κανέναν. Έρχονται τα βαγιάρια, τα οποία ο βασιλιάς συναντά με μεγάλη ενόχληση. Αφού άκουσε μια σύντομη ομιλία του Γκοντούνοφ, φοράει το καπέλο του Μονομάχοφ, κατηγορώντας τους μποϊάρους που τον ανάγκασαν να το κάνει, και φιλά τον Γκοντούνοφ, ο οποίος έκανε τολμηρές και απρόσεκτες ομιλίες «για το καλό του κράτους». Η απουσία του Σίτσκι δεν γίνεται απαρατήρητη και ο τσάρος, που δεν θέλει να ακούσει τους μεσάζοντες, διατάσσει την εκτέλεση.
Στα δωμάτια του Τσάρου, ο Γκοντούνοφ και ο Ζαχαρίν περιμένουν τον Τζον και ο Γκόντουνοφ λέει ότι ο βασιλιάς, θέλοντας να χωρίσει τη βασίλισσα, ξυπνά την ανιψιά της αγγλικής βασίλισσας. Ο εξοργισμένος Zakharyin ρωτά πώς ο Godunov προσπάθησε να αποτρέψει τον John και λαμβάνει την απάντηση ότι μπορεί να επηρεάσει τον John μόνο με έναν κυκλικό τρόπο. Ο Τζον μπαίνει και αναφέρει για την ταραχή στα πολωνικά στρατεύματα κοντά στο Ψσκοφ και για την προσδοκία ενός πρέσβη από τη Βαρσοβία, ο οποίος, κατά τη γνώμη του, έστειλε να ζητήσει ειρήνη. Παραγγέλλει τον Ζαχαρίν να ενημερώσει τους ανθρώπους για αυτό το μήνυμα. Λέει στον Godunov να συζητήσει με τον Άγγλο πρέσβη τους όρους για τον επερχόμενο γάμο. Προσπαθεί να μεσολαβήσει για τη βασίλισσα και δέχεται μια οργισμένη επίπληξη γεμάτη απειλές. Αφήνοντας μόνος του, ο Godunov κατηγορεί τον εαυτό του για την επιδεικνυόμενη καλοσύνη και αρνείται να προτιμήσει τη συνείδηση από το καλό του σκοπού. Στο σπίτι του Βασίλι Ιβάνοβιτς Σούισκι, οι μποϊμάρ Μυσισλάβσκι, Μπέλσκι και οι αδελφοί Ναγκόι συνωμοτούν για να καταστρέψουν τον Γκοντούνοφ. Αποφασίζουν, εκμεταλλευόμενοι τον ερεθισμό των ανθρώπων, να κατηγορήσουν όλα τα προβλήματα στον Godunov, και ο Shuisky προσφέρει στον Mikhail Bityagovsky να εκπληρώσει το σχέδιο. Αναλαμβάνει να επαναστατήσει τον λαό και να τον παρακινήσει να σκοτώσει. Ο Belsky προτείνει να στείλει τον Prokofy Kikin για το ίδιο. Ο Γκουντούνοφ έρχεται. Οι φιλοξενούμενοι διαλύονται βιαστικά. Ο Godunov παραπονιέται στον Shuisky ότι δεν τον αγαπά στη Δούμα, ο Shuisky τον διαβεβαιώνει για τη διάθεση και την υποστήριξή του και φεύγει, ξαφνικά κλήθηκε από τον τσάρο. Ο Γκόντουνοφ, που μένει μόνος του με τον Μπιταγκόβσκι, ανακαλύπτει την τέλεια γνωριμία του με τις προθέσεις του και, απειλώντας του με άνευ προηγουμένου εκτελέσεις, τον στέλνει στις ίδιες πλατείες για να πείσει τους ανθρώπους εναντίον του Σούισκι και του Μπέλσκι, που θέλουν να «δηλητηριάσουν τον βασιλιά με δηλητήριο».
Εν τω μεταξύ, η τσαρίνα δεν διατάζει τη μητέρα του τσαρέβιτς να αφήσει κανέναν άλλο να έρθει σε αυτόν, και ειδικά ο Γκοντούνοφ, εμπιστεύεται μόνο τη Νικήτα Ρομάνοβιτς Ζαχαρίν. Ο Ζαχαρίν έρχεται. Η βασίλισσα του λέει για τις φήμες στο παλάτι και ρωτά αν η υποψία της δεν είναι αλήθεια ότι ο βασιλιάς θέλει να την αφήσει με τον Δημήτριο. Η Ζαχαρίν της ζητά να είναι έτοιμη για τα πάντα, ο τσάρος να μην διαφωνήσει και να εμπιστευτεί τον Γκόντονοφ. Ο Τζον έρχεται με τον Γκοντούνοφ και, περιμένοντας τη βασίλισσα να ντύσει, ακούει τους όρους του Άγγλου πρέσβη και ρωτάει για τον Πολωνό που έφτασε μετά τον Γκαραμπούρντ, αναρωτιέται τι υπόσχεται η Πολωνία για ειρήνη και δεν θέλει να ακούσει φόβους για τον σκοπό αυτής της πρεσβείας. Η Βασίλισσα που έχει εισέλθει, ανακοινώνει το επικείμενο διαζύγιο. αγχωμένος, ο Δημήτρης υπόσχεται την κληρονομιά του UGLICH και, αφού άκουσε τη μεσολάβηση του Ζαχαρίν, τον απειλεί με εκτέλεση. Στην αίθουσα του θρόνου, ο Τζον δέχεται τον Πολωνό πρέσβη στην Γκαραμπούρντα. Τα αιτήματα του Μπατούρ είναι τόσο ταπεινωτικά (για να βγάλουν τον Σμόλενσκ, τον Πολότσκ, τον Νόβγκοροντ και τον Ψκόφ από το σύνταγμα της Λιβονίας και να δώσουν στην Πολωνία την Πολωνία) ότι, με γενικό μουρμουρητό, ο τσάρος πέφτει σε οργή και, αφού ακούσει την πρόσκληση του Πολωνού βασιλιά στις πολεμικές τέχνες, πρόκειται να κυνηγήσει τον πρέσβη του με σκυλιά και να τον πετάξει. τσεκούρι. Ο Γκαραμπούρντα σημειώνει ότι ο Τζον δεν γνωρίζει τις ειδήσεις σχετικά με τη σύνθλιψη των ρωσικών συντάξεων στα σύνορα, για το γεγονός ότι οι Σουηδοί παίρνουν τη Νάροβα και την κοινή τους εκστρατεία με τον Μπατούρ στο Νόβγκοροντ και, αφού υποσχέθηκε στον Τζον μια συνάντηση με τον βασιλιά στη Μόσχα, φεύγει. Ο Γκοντούνοφ, ο οποίος έτρεξε, επιβεβαιώνει όλα τα μηνύματα του Γκαραμπούρντα, αλλά ο τσάρος διατάζει να κρεμάσει ψεύτικους αγγελιοφόρους και να υπηρετήσει νικηφόρες προσευχές σε όλες τις εκκλησίες.
Στην πλατεία του Zamoskvorechye, το πλήθος ανησυχεί μπροστά από την αποθήκη, αγανακτισμένο με την τιμή του ψωμιού, τους δικαστικούς επιμελητές που παίρνουν δωροδοκίες και το γεγονός ότι ο βασιλιάς δεν εκτελεί τους δράστες. Ο Kikin εμφανίζεται, ντυμένος ως ξένος, κατηγορεί τον Godunov και αναφέρεται στο σημάδι του Θεού, "ένα αιματηρό, ουρά αστέρι". Λέει ότι είδε ένα θαύμα στο Κίεβο: η Σοφία σταυρό στη φωτιά και η φωνή που καλεί τον Γκοντούνοφ να ακουστεί. Ακούγονται φωνές για την υπεράσπιση του Γκοντούνοφ, φωνές που καλούν να νικήσουν τους υπερασπιστές και, τέλος, τη φωνή του Μπιταγκόβσκι, ο οποίος είναι ανοιχτός στο καφτάνι με ένα διαγραμμένο τραγούδι στα χείλη του. Λέει ότι ο Shuisky και ο Belsky επρόκειτο να δηλητηριάσουν τον βασιλιά, αλλά ο Godunov έριξε το δηλητηριασμένο κέικ στο σκυλί. Όταν ο Bityagovsky μπερδεύεται με έναν περιπλανώμενο που έχει δει ένα θαύμα, τον καλεί ονομαστικά και λέει ότι στάλθηκε σκόπιμα. Εμφανίζεται ο Γρηγόριος Γκόντονοφ, ανακοινώνοντας ότι ο Μπόρις Γκόντονοφ αγοράζει όλες τις προμήθειες από το δικό του ταμείο και θα τα διανείμει χωρίς μετρητά αύριο. Οι άνθρωποι σπεύδουν να Kikin. Στα βασιλικά δωμάτια, η βασίλισσα, η αδελφή του Godunov, η Ιρίνα και η σύζυγός του, η Μαρία, βλέπουν τον κομήτη. Ο βασιλιάς την κοιτάζει από τη βεράντα. Οι σοφοί και οι μάγοι ήρθαν να αποκαλύψουν τι ήταν ο κομήτης. Ο John εμφανίζεται και δηλώνει ότι κατάλαβε το σημάδι: ο κομήτης ανακοινώνει το θάνατό του. Ζητά συγχώρεση από τη βασίλισσα και, επιθυμώντας να μάθει ακριβώς την ώρα του θανάτου, ώστε να μην πεθάνει χωρίς μετάνοια, καλεί τους μάγους. Λένε Kirillin ημέρα. Κατόπιν αιτήματος του Τσάρ Γκόντονοφ, διαβάζει τη συνοδική, όπου αναφέρονται τα θύματά του, ο Τζον συμπληρώνει τη λίστα. Ένας μπάτλερ φτάνει από το Sloboda με ένα μήνυμα ότι μια χειμερινή ημέρα το παλάτι κάηκε από κεραυνούς. Αναστατωμένος, ο Τζον ζητάει από όλους για συγχώρεση, προσεύχεται με πάθος και ζητά από τον Φεντόρ πώς θα κυβερνήσει, αλλά ο Φεντόρ ζητά να βάλει κάποιον άλλο στο βασίλειο. Φέρνουν δύο γράμματα: σχετικά με την προσέγγιση του Χαν στη Μόσχα και την εξέγερση γύρω από το Καζάν. Φέρνουν ένα σχέδιο που έχει ζήσει σε απομόνωση για τριάντα χρόνια. Ο Ιωάννης, που μένει μόνος του, μιλάει για τις δυστυχίες που έπληξαν τη Ρωσία και ζητά συμβουλές. Το σχηματικό καλεί πολλούς ανθρώπους που είναι σε θέση να αντέξουν τον εχθρό - όλοι καταστρέφονται από τον βασιλιά. Μιλά για τον πρίγκιπα, αλλά ο πρίγκιπας είναι νεκρός. Έχοντας οδηγήσει τον προγραμματιστή, ο Ιωάννης αναγκάζει τους μποϊάρους του Μστίσλαβσκι, του Μπέλσκι, του Ζαχαρίν και του Γκοντούνοφ να φιλήσουν τον σταυρό, επειδή θα υπηρετήσουν τον Φεντόρ, και ο πέμπτος διορίζει τον Ιβάν Πετρόβιτς Σούσκικι αν επιβιώσει κοντά στο Ψκόφ. Στέλνει πρεσβευτές στη Λιθουανία για να ολοκληρώσει την ειρήνη με τον Μπατούρ υπό τις πιο ταπεινωτικές συνθήκες, πιστεύοντας ότι μετά το θάνατό του ο Μπατούρ θα απαιτήσει ακόμη περισσότερα, και επιθυμώντας με την ανυπόφορη ταπείνωση του να εξιλεώσει τις αμαρτίες.
Στο Κύριλλο, η ημέρα του βασιλιά είναι καλύτερη. Ο Γκουντούνοφ καλεί κρυφά τις μάγισσες και λένε ότι η μέρα δεν έχει τελειώσει ακόμα. Ο Γκοντούνοφ προβλέπει ο αυτοκρατορικός θρόνος, τα τρία αστέρια που τον χωρίζουν από το μεγαλείο του αστεριού και ο κύριος μυστηριώδης αντίπαλός του τιμάται ("αδύναμος, αλλά ισχυρός - αθώος, αλλά ένοχος - όχι ο ίδιος", "σκοτωμένος, αλλά ζωντανός"). Ο Δρ Jacobi φτάνει, απαντώντας στον Godunov, ότι ο τσάρος πρέπει να προστατευτεί από τον ερεθισμό, και γι 'αυτό ο Belsky ονόμασε τους buffoons. Ο Godunov δέχεται τον Bityagovsky και ανακαλύπτει ότι οι άνθρωποι είναι εξοργισμένοι εναντίον του Shuisky και του Belsky. Εν τω μεταξύ, ο Ιωάννης εξετάζει τους θησαυρούς, ψάχνοντας για δώρα στην αγγλική βασίλισσα και νύφη, ένας γελωτοποιός περιστρέφεται κοντά στο βασιλιά, οι βουβάνοι στα γειτονικά δωμάτια θα περιμένουν μια πινακίδα. Την επόμενη μέρα ο Τσάρος διορίζει την εκτέλεση των Μάγων και στέλνει τον Μπόρις να τους το ανακοινώσει. Είναι θριαμβευτικός, αλλά ύποπτος και επιρρεπής σε ερεθισμό. Έχοντας καθίσει παίζοντας σκάκι με τον Μπέλσκι, πέφτει ο βασιλιάς. Ο Γκοντούνοφ επιστρέφει και, έχοντας οδηγήσει τον βασιλιά σε φρενίτιδα με ουσιαστική σιωπή, ανακοινώνει την απάντηση των Μάγων ότι η επιστήμη τους είναι αξιόπιστη και ότι ο Κιριλίν δεν έχει περάσει ακόμη την ημέρα. Σε θυμό, ο Τζον καλεί τον Γκόντονοφ προδότη, τον κατηγορεί για απόπειρα στη ζωή του, καλεί τους εκτελεστές και πέφτει. Γενική σύγχυση. Ο βασιλιάς καλεί τον εξομολογητή, τους μποϊάρους - γιατρούς, τρέχουν λανθασμένα βούβαλους. Ο Τζον πεθαίνει. Οι άνθρωποι στην πλατεία φωνάζουν ότι ο βασιλιάς παρενοχλήθηκε από τους Shuisky και Belsky, και ο μπερδεμένος Fedor αναθέτει εξηγήσεις στον Godunov. Ο Γκόντουνοφ στέλνει τους μπούρους στην εξορία, τον Μυστισλάφσκι, τον οποίο, μαζί με τον Νάγκυ, τον Μπιταγκόβσκι κατηγορεί για προβλήματα, το μοναστήρι, το Ναγίχ - στην UGLICH μαζί με τον Τσαρίτσα και τον Δημήτριο. Fedor, λυγμός, αγκαλιάζει τον Godunov. Οι άνθρωποι στην πλατεία επαινούν και τα δύο.