Μάρτιος 1865. Στις Ηνωμένες Πολιτείες, κατά τη διάρκεια του εμφυλίου πολέμου, πέντε τολμηροί-βόρειοι βγαίνουν από ένα μπαλόνι από τα νότια του Ρίτσμοντ. Μια φοβερή καταιγίδα ρίχνει τέσσερις από αυτούς στην ακτή ενός ακατοίκητου νησιού στο Νότιο Ημισφαίριο. Ο πέμπτος άντρας και ο σκύλος του κρύβονται στη θάλασσα έξω από την ακτή. Αυτό το πέμπτο - ένας συγκεκριμένος Cyres Smith, ένας ταλαντούχος μηχανικός και επιστήμονας, η ψυχή και ο ηγέτης μιας ομάδας ταξιδιωτών - διατηρεί ακούσια τους συντρόφους του σε ένταση για αρκετές ημέρες, οι οποίοι δεν μπορούν να βρουν πουθενά ούτε αυτός ούτε ο κορυφαίος σκύλος. Ο πρώην σκλάβος υποφέρει πάνω απ 'όλα, και τώρα ο πιστός υπηρέτης του Σμιθ είναι ο Νέγρος Ναμπ. Στο μπαλόνι ήταν επίσης ένας δημοσιογράφος πολέμου και ο φίλος του Σμιθ, ο Gideon Spilet, ένας πολύ ενεργητικός και αποφασιστικός άνθρωπος με μυαλό. ναύτης Pencrof, ένας τολμηρός και τολμηρός τολμηρός. Ο δεκαπεντάχρονος Χάμπερτ Μπράουν, ο γιος του καπετάνιου του πλοίου στο οποίο έπλεε ο Πέμπροφ, παρέμεινε ορφανός και στον οποίο ο ναυτικός αναφέρεται ως γιος του. Μετά από μια κουραστική αναζήτηση, ο Nab βρήκε τελικά τον ανεξήγητα αποθηκευμένο οικοδεσπότη του, ένα μίλι από την ακτή. Κάθε ένας από τους νέους εποίκους του νησιού έχει αναντικατάστατα ταλέντα, και υπό την ηγεσία του Cyres και του Spilet, αυτοί οι γενναίοι άνθρωποι συγκεντρώνονται και γίνονται μια ενωμένη ομάδα. Πρώτον, χρησιμοποιώντας τα πιο απλά μέσα, στη συνέχεια παράγοντας όλο και πιο περίπλοκα αντικείμενα εργασίας και οικιακών ειδών στα δικά τους μικρά εργοστάσια, οι έποικοι εξοπλίζουν τη ζωή τους. Κυνηγούν, συλλέγουν βρώσιμα φυτά, στρείδια και στη συνέχεια εκτρέφουν κατοικίδια ζώα και ασχολούνται με τη γεωργία. Τακτοποιούν τη στέγαση ψηλά στον βράχο, σε μια σπηλιά που ελευθερώνεται από το νερό. Σύντομα, χάρη στην εργατικότητα και τη νοημοσύνη τους, οι άποικοι δεν ξέρουν πλέον την ανάγκη για φαγητό, ρούχα, ζεστασιά και άνεση. Έχουν τα πάντα εκτός από ειδήσεις για την πατρίδα τους, την τύχη για την οποία ανησυχούν πολύ.
Μόλις επέστρεψαν στην κατοικία τους, που τους αποκαλούσαν το Παλάτι Γρανίτη, βλέπουν ότι οι πίθηκοι κυριαρχούν μέσα Μετά από λίγο καιρό, λες και υπό την επήρεια του τρελού φόβου, οι μαϊμούδες ξεκινούν να πηδούν έξω από τα παράθυρα, και το χέρι κάποιου ρίχνει τη σκάλα σχοινιού που ανέβασαν οι πίθηκοι στο σπίτι. Μέσα, οι άνθρωποι βρίσκουν έναν άλλο μαϊμού - έναν ουρακοτάγκο, τον οποίο διατηρούν και αποκαλούν τον θείο Jupe. Στο μέλλον, ο Jupe γίνεται φίλος, υπηρέτης και απαραίτητος βοηθός στους ανθρώπους.
Μια άλλη μέρα, οι έποικοι βρίσκουν στην άμμο ένα κουτί με εργαλεία, πυροβόλα όπλα, διάφορες συσκευές, ρούχα, μαγειρικά σκεύη και βιβλία στα αγγλικά. Οι έποικοι αναρωτιούνται από πού μπορεί να προέρχεται αυτό το κουτί. Από το χάρτη, που επίσης εμφανίστηκε στο κουτί, βρίσκουν ότι δίπλα στο νησί τους, στον χάρτη που δεν έχει σημειωθεί, είναι το νησί Tabor. Ο ναυτικός Pencrof είναι πρόθυμος να πάει σε αυτόν. Με τη βοήθεια των φίλων του, χτίζει ένα bot. Όταν το bot είναι έτοιμο, όλοι μαζί πηγαίνουν για ένα δοκιμαστικό ταξίδι γύρω από το νησί. Κατά τη διάρκεια αυτού, βρίσκουν ένα μπουκάλι με μια σημείωση που λέει ότι ο ναυαγός περιμένει τη σωτηρία στο νησί Tabor. Αυτή η εκδήλωση ενισχύει την εμπιστοσύνη του Pencroff στην επίσκεψη σε ένα γειτονικό νησί. Η Pencrof, ο δημοσιογράφος Gideon Spilet και ο Harbert ξεκίνησαν. Φτάνοντας στο Tabor, ανακαλύπτουν μια μικρή καλύβα όπου, από όλες τις ενδείξεις, κανείς δεν ζει εδώ και πολύ καιρό. Διασκορπίζονται γύρω από το νησί, χωρίς να ελπίζουν να δουν ένα ζωντανό άτομο και προσπαθούν να βρουν τουλάχιστον τα λείψανα του. Ξαφνικά ακούνε τον Χάρμπερτ να φωνάζει και σπεύδουν να τον βοηθήσουν. Βλέπουν τον Χάρμπερτ να παλεύει με ένα είδος πλάσματος μαϊμού. Ωστόσο, η μαϊμού αποδεικνύεται άγριος άνθρωπος. Οι ταξιδιώτες τον δεσμεύουν και τον μεταφέρουν στο νησί τους. Του δίνουν ένα ξεχωριστό δωμάτιο στο Granite Palace. Χάρη στην προσοχή και τις ανησυχίες τους, ο άγριος μετατρέπεται σύντομα σε πολιτισμένος άνθρωπος και τους λέει την ιστορία του. Αποδεικνύεται ότι το όνομά του είναι Ayrton, είναι πρώην εγκληματίας, ήθελε να καταλάβει το ιστιοφόρο Duncan και με τη βοήθεια των ίδιων βυθισμάτων της κοινωνίας μετατράπηκε σε πειρατικό πλοίο. Ωστόσο, τα σχέδιά του δεν προοριζόταν να πραγματοποιηθούν και ως τιμωρία πριν από δώδεκα χρόνια έμεινε στο ακατοίκητο νησί Ταμπόρ, ώστε να συνειδητοποιήσει την πράξη του και να εξιλεώσει την αμαρτία του. Ωστόσο, ο ιδιοκτήτης του "Duncan" Eduard Glenarvan είπε ότι κάποια μέρα θα επιστρέψει για τον Ayrton. Οι έποικοι βλέπουν ότι ο Ayrton μετανοεί ειλικρινά από τις προηγούμενες αμαρτίες του, και προσπαθεί να είναι χρήσιμος σε αυτούς με κάθε τρόπο. Επομένως, δεν έχουν την τάση να τον κρίνουν για παρελθόντα παραπτώματα και να τον δεχτούν πρόθυμα στην κοινωνία τους. Ωστόσο, ο Ayrton χρειάζεται χρόνο, και ως εκ τούτου ζητά την ευκαιρία να ζήσει στο κοράλλι που οι έποικοι έχτισαν για τα οικόσιτα ζώα τους σε κάποια απόσταση από το Παλάτι του Γρανίτη.
Όταν το bot επέστρεψε στην καταιγίδα από το νησί Tabor τη νύχτα, σώθηκε από μια φωτιά, η οποία, όπως νόμιζαν, επιπλέοντάς την, ανάβει από τους φίλους τους. Ωστόσο, αποδεικνύεται ότι δεν συμμετείχαν σε αυτό. Αποδεικνύεται επίσης ότι ο Άιρτον δεν πέταξε ένα μπουκάλι σημείωση στη θάλασσα. Οι έποικοι δεν μπορούν να εξηγήσουν αυτά τα μυστηριώδη γεγονότα. Τείνουν όλο και περισσότερο στην ιδέα ότι, εκτός από αυτούς, στο νησί του Λίνκολν, καθώς τον βάπτισαν, υπάρχει κάποιος άλλος, ο μυστηριώδης ευεργέτης τους, που συχνά βοηθάει στις πιο δύσκολες καταστάσεις. Ξεκινούν ακόμη και μια αποστολή αναζήτησης με την ελπίδα να εντοπίσουν τον τόπο κατοικίας του. Ωστόσο, η αναζήτηση δεν έχει αποτέλεσμα.
Το επόμενο καλοκαίρι (γιατί από τότε που ο Ayrton εμφανίστηκε στο νησί τους, και προτού τους πει την ιστορία του, έχουν περάσει πέντε μήνες και το καλοκαίρι έχει τελειώσει και είναι επικίνδυνο να ταξιδέψεις στην κρύα εποχή), αποφασίζουν να επιστρέψουν Τα νησιά Tabor για να αφήσουν μια σημείωση στην καλύβα. Στο σημείωμα, σκοπεύουν να προειδοποιήσουν τον καπετάνιο Glenarvan αν επιστρέψει ότι ο Άιρτον και άλλα πέντε θύματα που καταστρέφονται περιμένουν βοήθεια σε ένα γειτονικό νησί.
Οι έποικοι ζουν στο νησί τους για τρία χρόνια. Η ζωή τους, η οικονομία τους έφτασαν στην ευημερία. Συλλέγουν ήδη πλούσιες καλλιέργειες σιταριού από έναν κόκκο, που βρέθηκε στην τσέπη του Χάρμπερτ πριν από τρία χρόνια, έχτισαν έναν μύλο, έθεσαν πουλερικά, εξοπλίζουν πλήρως την κατοικία τους, έφτιαξαν νέα ζεστά ρούχα και κουβέρτες για τους εαυτούς τους από μαλλί από μουφλόν. Ωστόσο, η ειρηνική ζωή τους επισκιάζεται από ένα περιστατικό που τους απειλεί με θάνατο. Κάποτε, κοιτάζοντας τη θάλασσα, βλέπουν ένα καλά εξοπλισμένο πλοίο στο βάθος, αλλά μια μαύρη σημαία πετά πάνω από το πλοίο. Το πλοίο αγκυροβολεί έξω από την ακτή. Δείχνει όμορφα όπλα μεγάλης εμβέλειας. Ο Άιρτον γλιστρά στο πλοίο κάτω από την κάλυψη της νύχτας για να πραγματοποιήσει αναγνώριση. Αποδεικνύεται ότι υπάρχουν πενήντα πειρατές στο πλοίο. Θαύμα απομακρυνόμενος από αυτούς, ο Ayrton επιστρέφει στην ακτή και λέει στους φίλους του ότι πρέπει να προετοιμαστούν για τη μάχη. Το επόμενο πρωί δύο καράβια κατεβαίνουν από το πλοίο. Στο πρώτο, οι έποικοι πυροβολούν τρεις, και επιστρέφει, οι δεύτερες προσγειώνονται στην παραλία, και οι έξι εναπομείναντες πειρατές κρύβονται στο δάσος. Τα κανόνια καίγονται από το πλοίο και πλησιάζει ακόμη περισσότερο στην ακτή. Φαίνεται ότι τίποτα δεν έχει τη δύναμη να σώσει μια χούφτα εποίκων. Ξαφνικά ένα τεράστιο κύμα ανεβαίνει κάτω από το πλοίο και βυθίζεται. Όλοι οι πειρατές πεθαίνουν. Όπως αποδεικνύεται αργότερα, το πλοίο ανατινάχτηκε από ένα ορυχείο και αυτό το γεγονός τελικά πείθει τους κατοίκους του νησιού ότι δεν είναι μόνοι εδώ.
Στην αρχή, δεν πρόκειται να εξοντώσουν τους πειρατές, θέλοντας να τους δώσουν την ευκαιρία να ζήσουν μια ειρηνική ζωή. Αλλά αποδεικνύεται ότι οι ληστές δεν είναι ικανοί για αυτό. Αρχίζουν να ληστεύουν και να καίνε τα σπίτια των εποίκων. Ο Ayrton πηγαίνει στο κοράλλι για να επισκεφθεί τα ζώα. Οι πειρατές τον πιάσουν και τον πήγαν σε μια σπηλιά, όπου θέλουν να τον βασανίσουν για να συμφωνήσουν να πάνε στο πλευρό τους με βασανιστήρια. Ο Άιρτον δεν τα παρατάει. Οι φίλοι του πηγαίνουν στη βοήθειά του, αλλά τραυματίζονται σοβαρά στο κοράλλι του Χάρμπερτ και οι φίλοι του παραμένουν σε αυτόν, ανίκανοι να επιστρέψουν με τον νεαρό άνδρα που πέθανε. Μετά από λίγες μέρες, φεύγουν ακόμα για το Παλάτι του Γρανίτη. Ως αποτέλεσμα της μετάβασης, ο Χάρμπερτ ξεκινά έναν κακοήθη πυρετό, πέθανε. Για άλλη μια φορά, η πρόνοια παρεμβαίνει στη ζωή τους και το χέρι του καλού μυστηριώδους φίλου τους τους ρίχνει το απαραίτητο φάρμακο. Ο Χάρμπερτ αναρρώνει πλήρως. Οι έποικοι σκοπεύουν να δώσουν το τελευταίο πλήγμα στους πειρατές. Πηγαίνουν στο κοράλλι, όπου σκοπεύουν να τα βρουν, αλλά βρίσκουν τον Άιρτον, ο οποίος είναι εξαντλημένος και μόλις ζωντανος, και κοντά, τα πτώματα των ληστών. Ο Ayrton αναφέρει ότι δεν ξέρει πώς κατέληξε στο κοράλλι, που τον έφερε από το σπήλαιο και σκότωσε τους πειρατές. Ωστόσο, αναφέρει ένα θλιβερό νέο. Πριν από μια εβδομάδα, οι ληστές πήγαν στη θάλασσα, αλλά, χωρίς να γνωρίζουν πώς να ελέγχουν το bot, το έσπασαν στους παράκτιους υφάλους. Το ταξίδι στο Tabor πρέπει να αναβληθεί μέχρι την κατασκευή ενός νέου οχήματος. Τους επόμενους επτά μήνες, ο μυστηριώδης ξένος δεν αισθάνεται. Εν τω μεταξύ, ένα ηφαίστειο ξυπνά στο νησί, το οποίο οι άποικοι πίστευαν ότι ήταν ήδη νεκρό. Χτίζουν ένα νέο μεγάλο πλοίο, το οποίο, εάν είναι απαραίτητο, θα μπορούσε να τα παραδώσει σε κατοικημένη γη.
Ένα βράδυ, που ετοιμάζεται ήδη να κοιμηθεί, οι κάτοικοι του Granite Palace ακούνε ένα κουδούνι. Ο τηλεγράφος που πέρασαν από το κοράλλι στο σπίτι τους λειτουργεί. Καλούνται επειγόντως στο κοράλλι. Εκεί βρίσκουν ένα σημείωμα που τους ζητά να πάνε στο επιπλέον καλώδιο. Το καλώδιο τους οδηγεί σε ένα τεράστιο σπήλαιο όπου, κατά την έκπληξή τους, βλέπουν ένα υποβρύχιο. Σε αυτό, εξοικειώνονται με τον αφέντη του και τον προστάτη του, τον καπετάνιο Nemo, τον Ινδό πρίγκιπα Ντακάρ, ο οποίος αγωνίζεται για την ανεξαρτησία της πατρίδας του όλη του τη ζωή. Αυτός, ήδη ένας εξήντα ετών άντρας που έθαψε όλους τους συνεργάτες του, είναι κοντά στο θάνατο. Το Nemo δίνει σε νέους φίλους ένα φέρετρο με κοσμήματα και προειδοποιεί ότι όταν ξεσπάσει το ηφαίστειο, το νησί (όπως είναι η δομή του) θα εκραγεί. Πέθανε, οι έποικοι ανοίγουν τις πόρτες του σκάφους και το χαμηλώνουν κάτω από το νερό, και χτίζουν το νέο πλοίο ακούραστα όλη την ημέρα. Ωστόσο, δεν έχουν χρόνο να το τελειώσουν. Όλη η ζωή χάνεται κατά την έκρηξη του νησιού, από την οποία παραμένει μόνο ένας μικρός ύφαλος στον ωκεανό. Οι έποικοι, που πέρασαν τη νύχτα σε μια σκηνή στην ακτή, ρίχνονται στη θάλασσα από ένα κύμα αέρα. Όλοι τους, με εξαίρεση τον Jupe, παραμένουν ζωντανοί. Για περισσότερες από δέκα μέρες κάθονται στον ύφαλο, σχεδόν πεθαίνουν από πείνα και δεν ελπίζουν πλέον για τίποτα. Ξαφνικά βλέπουν ένα πλοίο. Αυτός είναι ο Ντάνκαν. Σώζει όλους. Όπως αργότερα αποδεικνύεται, ο καπετάνιος Νέμο, ενώ το bot ήταν ακόμη άθικτο, επιπλέει πάνω του στον Tabor και άφησε ένα σημείωμα στους διασώστες.
Επιστρέφοντας στην Αμερική για τα κοσμήματα που έδωσε ο καπετάνιος Νέμο, οι φίλοι τους αγοράζουν ένα μεγάλο κομμάτι γης και ζουν σε αυτό με τον ίδιο τρόπο που ζούσαν στο νησί του Λίνκολν.